Ученые создадут генетический «Ноев ковчег»

НИА-Хакасия
Амбициозный проект по сбору высококачественных последовательностей генома 66 000 видов позвоночных по всей Земле, включая млекопитающих, птиц, рептилий, амфибий и рыбу, анонсировал Международный консорциум, включающий более 50 институтов. Общий проект обойдется в 600 миллионов долларов, сообщает «hi-news».
Проект геномов позвоночных организует консорциум под названием Genome 10K, или G10K. Как следует из названия, эта группа первоначально планировала секвенировать геномы не менее 10 000 видов позвоночных животных, но теперь, благодаря огромным успехам и снижению стоимости технологий секвенирования генов, G10K, решила поднять ставки и секвенировать как самцов, так и самок каждого из приблизительно 66 000 видов на Земле.
Создатели проекта объявили о новых целях во время конференции G10K 2018, которая проводилась в Университете Рокфеллера в Нью-Йорке. Проект будет включать более 150 экспертов из 50 институтов и 12 стран.
Вместе с объявлением представили 14 новых высококачественных геномов видов, представляющих все пять классов позвоночных, включая геномы большой подковообразной летучей мыши, канадской рыси, утконоса, колибри Анны, попугая какапо (которых осталось всего 150), черепахи пустыни Гуд, хвостатой червяги (странной амфибии, похожей на змею) и анабаса. Эти 14 геномов и другие, собранные в рамках проекта, будут доступны ученым для целей исследования.
Проект также займется важными вопросами в биологии и медицине, что сразу же станет полезно для изучения эволюции, геномики и консервационной биологии.
Для создания высококачественных сборок генома, ученые отдают предпочтение «длинным записями», нежели коротким, то есть когда технологии секвенирования производят длинные фрагменты генетических данных. Из них проще было бы собирать ДНК-последовательности в целые хромосомы. Вместо того, чтобы работать с головоломкой из миллионов отдельных кусочков, длинные записи приведут к головоломке из тысяч таковых.
Кроме того, ученые будут воздерживаться от объединения мужских и женских хромосом в один геном — обычная практика, которая приводит к слишком большим ошибкам. Вместо этого команда будет собирать как отцовскую, так и материнскую ДНК отдельных особей в процессе фазирования. Каждый вид будет собираться по отдельности и так, чтобы работу не нужно было повторять в будущем.